Sbírka Muzea umění a designu Benešov je od července 2002 zapsaná v Centrální evidenci sbírek pod evidenčním číslem MHB/002–04–30/111002. V současnosti čítá 13 820 sbírkových předmětů volného umění a designu.

Prvotní sbírková kolekce byla v roce 1990 sestavena z několika převodů, mezi nimiž dominoval soubor české malby druhé poloviny 20. století z Českého muzea výtvarných umění. Sbírka začala být brzy doplňována o další soubory grafiky, kresby, fotografie, grafického designu, plastiky a designové produkce. Muzejní sbírka je orientována především na tvorbu českých umělců/umělkyň a designérů/desig­nérek druhé poloviny 20. století po současnost s důrazem na regionální umění. V menší míře zahrnuje i díla starších epoch nebo díla zahraničních autorů.

Podsbírka grafického designu je zaměřena především na českou a československou plakátovou i knižní tvorbu 2. poloviny 20. století a na mapování autorských logotypů a vizuálních identit (vytvořených převážně mezi lety 1990–1995). Jde o systematicky budovanou kolekci, která zachycuje dynamické období proměn grafického designu na našem území, a zajímavě reflektuje rychlý rozvoj podnikatelského prostředí, institucí i kulturních iniciativ v době po listopadu 1989.

Sbírka přesahuje čistě dokumentační rámec a má svou výtvarnou i výzkumnou hodnotu, zejména pro badatele v oblasti vizuální komunikace.

Podsbírka designu mapuje vývoj českého a slovenského užitého designu od počátku 20. století po současnost. Zaměřuje se především na oblast každodennosti – zastoupeny jsou produkty jako sedací nábytek, kuchyňské potřeby, svítidla, rádia, telefony, fotoaparáty, hračky, domácí doplňky či psací stroje.

Podsbírka grafiky mapuje vývoj české grafické tvorby od počátku 20. století až po současnost, s důrazem na autory působící především v Čechách. Zastoupena jsou díla výrazných osobností jako Adolf Born, Zdeněk Sýkora, Ivana Lomová, Adriena Šimotová, Milan Grygar, Václav Boštík, Pavel Brázda, Jaromír 99 či Jiří Sozanský. Z regionálních autorů je ve sbírce zastoupen například Jan Hejtmánek.

Významné místo v podsbírce zaujímá také tvorba švýcarské grafičky Silvie Billeter, a to prostřednictvím reprezentativního souboru Hledat Petrkov.

Podsbírka fotografie dokumentuje vývoj média od daguerrotypie až po současnost. Zahrnuje jak historické techniky, tak i současné přístupy a pokrývá široké spektrum námětů. Zastoupena jsou díla významných osobností české a slovenské fotografie, jako jsou Dagmar Hochová, Bohdan Holomíček, Ján Šmok, Magdaléna Robinsonová, Eva Fuková, Vladimír Birgus, Dana Bleyová, Jan Durina či americká fotografka Cindy Sherman. Sbírka odráží nejen technologický vývoj fotografie, ale i její proměny v uměleckém a společenském kontextu.

Významnou součást sbírky MUD v Benešově tvoří dar historika umění a někdejšího ředitele Uměleckoprůmys­lového muzea v Praze Jiřího Šetlíka. Obsahuje rozsáhlou kolekci novoročenek a grafických listů, které během let získal od širokého okruhu výtvarníků, vědců a divadelníků.

Další ucelenou část představuje soubor darovaný k 20. výročí muzea v roce 2010. Zahrnuje 60 děl umělců spojených se skupinou UB 12, jejímž byl Jiří Šetlík teoretickým průvodcem. Mezi zastoupené autory patří například Adriena Šimotová, Jiří John, Věra Janoušková, Vladimír Janoušek, František Burant a další. Mimo tuto skupinu jsou ve sbírce například díla Jiřího Vovese či Miloslava Chlupáče.

Podsbírka malby zahrnuje převážně tvorbu regionálních autorů. Významně jsou zde zastoupena díla Ladislava Šímy, Václava Pavlíka, Františka Holoubka a Vladimíra Antuška. Sbírku dále obohacují práce výtvarníků spojených s československou a českou uměleckou scénou 80. a 90. let. Mezi zastoupenými autory jsou například Michael Rittstein, Jiří David, Ivana Lomová, Josef Císařovský, Marie Blabolilová či Jiří Černický.

Ucelený soubor tvoří také kolekce obrazů malíře Zdeňka Kirchnera, českého emigranta působícího v Paříži. V návaznosti na tuto linii byla sbírka dále rozšířena o díla Františka Januly, dalšího českého umělce tvořícího ve stejném období ve Francii.

Podsbírka kresby zahrnuje díla českých a slovenských umělců od počátku 20. století až po současnost. Zastoupena jsou jména jako Adriena Šimotová, Ivan Ouhel, Jiří Anderle, Daisy Mrázková, Dalibor Chatrný či Veronika Bromová.

Z autorů spjatých s Benešovem jsou ve sbírce zastoupeni Vladimír Antušek, Václav Pavlík, Ladislav Šíma nebo Vladimír Cidlinský.

Podsbírka plastiky je zaměřena na sochařskou tvorbu od druhé poloviny 20. století až po současnost. Jejím jádrem jsou sádrové odlitky Jiřího Vodrážky. Sbírka dále zahrnuje díla předních českých sochařů, mezi nimiž nechybí Jan Štursa, Miloslav Chlupáč, Karel Nepraš, Olbram Zoubek, Čestmír Suška či sochařky Věry Janouškové.

Podsbírka se zaměřuje na dokumentaci architektonického vývoje Benešovska od konce 19. století až po současnost. Sbírka obsahuje převážně dokumentační materiály s uměleckým přesahem, které zachycují urbanistickou proměnu regionu a jeho architektonické dědictví.